Equips liderats pel Consell Superior d’Investigacions Científiques (CSIC) i el Barcelona Supercomputing Center – Centro Nacional de Supercomputación (BSC-CNS) han desenvolupat una nova estratègia per reprogramar bacteris sense necessitat d’inserir molècules externes, segons han informat aquest dimecres. La tècnica, anomenada GenRewire, permet reorientar les funcions presents en el genoma de les proteïnes perquè desenvolupin noves capacitats, en concret, la de degradar partícules de plàstic. L’investigador del CSIC i coordinador de l’estudi, Manuel Ferrer, ha posat en valor el mètode, que no necessita “alterar l’equilibri genètic de la cèl·lula amb elements externs”, a diferència del procés emprat habitualment en biotecnologia.
El CSIC, entitat adscrita al Ministeri de Ministeri de Ciència, Innovació i Universitats, i el BSC-CNS han aplicat aquest mètode per a dotar al bacteri ‘Escherichia coli’ de la capacitat de degradar partícules de plastic PET (Polietilè Tereftalat) de mida petita. Es tracta de nanoplàstics omnipresents en la vida quotidiana, utilitzats en la fabricació d’envasos i en la indústria tèxtil, que s’han convertit en contaminants amb un alt impacte en el medi ambient i en la salut.
L’investigador del BSC i coordinador de l’estudi Víctor Guallar creu que l’enfocament és “únic” perquè combina “intel·ligència artificial (IA), simulació per supercomputació i edició genètica precisa per a incorporar noves activitats en proteïnes naturals”. Aquest fet fa que la cèl·lula pugui mantenir el seu equilibri biològic.
La tècnica Genwire consisteix a analitzar en un supercomputador les proteïnes codificades per un genoma i, posteriorment, reprogramar-les mitjançant eines computacionals perquè realitzin una funció desitjada.
Per la seva banda, l’investigador del BSC i un dels primers autors de l’estudi ,Joan Giménez, ha destacat que el procés només triga tres o quatre setmanes, gràcies als avenços en mètodes estructurals d’IA, així com als seus algorismes de simulació mecànica i al poder de supercomputació del MareNostrum 5.
